O plano de atividades decorre da MISSÃO e NATUREZA deste Centro, que é desenvolvido a partir da experiência do anterior centro CLEGI e que reúne uma vasta equipa de investigadores com currículo científico bastante significativo.

A missão do COMEGI é desenvolver investigação avançada e inovadora de forma a obter novos resultados nos principais desafios das Ciências da Gestão modernas: 

1. Cobrindo a área principal da Gestão Pública que, infelizmente, é ignorada pela maioria das unidades de investigação na área da Gestão, relacionando as questões com os contextos orçamentais, financeiros e fiscais;
2. Prosseguindo linhas de investigação sobre e-Business, Marketing e Mercados Social e de Trabalho, dando especial atenção aos principais desafios, como e-Public Procurement e Digital Banking;
3. Selecionando questões importantes sobre a Gestão de Recursos Humanos, Liderança, Motivação e Avaliação do Desempenho;
4. Centrando-se na Gestão da Tecnologia, incluindo a Gestão de Operações, os Sistemas Industriais e a Competitividade.

A estratégia adotada pelo COMEGI baseia-se em três grandes princípios científicos:

1. Uma abordagem sistémica para entender, diagnosticar e recomendar melhores estratégias e ações.
2. Uma integração interdisciplinar de múltiplos conhecimentos consequentes da própria natureza do COMEGI.
3. Uma "abordagem orientada para o problema" que segue o chamado Modo 2 de investigação, o que implica que a investigação deve basear-se em problemas e sistemas reais.

Área 1: Economia, Contexto Social e Financeiros:

• Linha 1: Orçamento educacional e público.
• Linha 2: Mercados Social e do Trabalho.
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Área 2: Negócios e Mercados:

• Linha 3: Modelos do Consumidor e Marketing.
• Linha 4: Modelagem Setorial – Turismo, Desporto e Saúde.
• Linha 5: Auditoria e métodos Fiscais.
• Linha 6: e-Procurement, negócios e e-Learning.
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Área 3: Recursos Humanos: Competências, Sustentabilidade e Avaliação:

• Linha 7: Recursos Humanos – Desenvolvimento de Competências e Avaliação de Desempenho.
• Linha 8: Inovação, Sustentabilidade e Responsabilidade Social.
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Área 4: Gestão Tecnológica:

• Linha 9: Otimização e Gestão de Sistemas Industriais.
• Linha 10: Gestão Operacional, Logística e Competitividade Industrial.